Процес становлення Інституту в нових умовах був нелегким. Потрібно було заново розробляти нормативні та методичні документи для забезпечення наукової діяльності Інституту, налагоджувати співпрацю з українськими та закордонними науковими організаціями, створювати матеріально-технічну базу для забезпечення проведення науково-дослідних робіт. Також вкрай необхідно було вирішувати кадрові проблеми, адже у зв’язку із скороченням Збройних Сил України понад 100 досвідчених науковців звільнились та перейшли у новостворені цивільні та військові структури.
Історія створення Центрального науково-дослідного інституту Збройних Сил України
Центральний науково-дослідний інститут Збройних Сил України створено 14 лютого 1992 року на базі 39-го науково-дослідного інституту Військ Протиповітряної оборони Сухопутних військ СРСР.
На той час це була єдина в Україні наукова установа, що мала 20-річний досвід проведення наукових досліджень у військовій сфері, розвинену методологічну базу та широке коло наукових зв’язків. На момент створення в Інституті працювало 250 співробітників, з них 220 – військовослужбовці.
Крім того, для якісного вирішення завдань, що визначалися керівництвом Міністерства оборони та Збройних Сил України, потребувала зміни організаційно-штатна структура Інституту.
Попри всі складнощі й негаразди, колектив Інституту успішно виконував поставлені завдання, і завдяки самовідданій праці військових науковців, розумному проведенню організаційних заходів вдалося зберегти свої позиції у науковому просторі, примножити наукові здобутки.
23 квітня 1998 року на підставі постанови Кабінету Міністрів України № 550 Інститут отримав назву “Центральний науково-дослідний інститут Збройних Сил України” з метою приведення у відповідність із законодавством правового статусу науково-дослідних організацій Збройних Сил та підвищення рівня фундаментальних та прикладних досліджень в галузі воєнної науки.
Від дня заснування Інститут розташовувався у будинку по вулиці Дегтярівській, 11В, який до 1917 року належав до комплексу казарм 165-го піхотного Луцького полку. На підставі директиви Міністра оборони України № Д-1 від 2 січня 2007 року з метою створення єдиного навчально-наукового комплексу, раціонального використання фондів Київського гарнізону Інститут передислоковано до військового містечка на території Національного університету оборони України за адресою проспект Повітрофлотський, 28Б.
В умовах трансформації системи керівництва ЗС України та управління військами у 2020 році Інститут підпорядковано Головнокомандувачу Збройних Сил України.
